北京分子科学国家研究中心现有研究人员近600人，其中包括教授/研究员176人。中心凝聚了一批分子科学领域的高水平领军人才，包括中国科学院院士21人，发展中国家科学院院士9人，国家杰出青年基金获得者84人，教育部长江学者特聘教授23人，引进优秀人才61人，中组部“万人计划”杰出人才1人、科技创新领军人才19人、青年拔尖人才4人。此外，中心拥有一支由1800余名高质量研究生、博士后和高水平访问学者组成的流动人员队伍。