建设运行管理委员会负责协调国家研究中心建设运行发展的有关重大事项，审议国家研究中心的年度任务和经费预算，组织对国家研究中心及主任进行绩效考核和监督。建设运行管理委员会成员由组建单位、主管部门、地方科技管理部门、科学家代表及国家研究中心主任、副主任等人员组成。

北京分子科学国家研究中心第一届建设运行管理委员会

（按姓氏笔画为序）

主   任：林建华（北京大学）

             张    涛（中国科学院）

副主任：高毅勤（北京大学）

             张德清（中国科学院化学研究所）

委   员：王    颖（中国科学院前沿科学与教育局）

             许    强（北京市科学技术委员会）

             吴    凯（北京大学）

             范青华（中国科学院化学研究所）

             姚建年（中国科学院化学研究所）

             席振峰（北京大学）

             雷朝滋（教育部科学技术司）